Исторически методы микробиологического анализа смывов развивались параллельно с общим прогрессом в микробиологии. В XIX веке, с открытием микроорганизмов и разработкой первых методов культивирования, появились и первые попытки выявить бактерии на поверхностях. В XX веке, с развитием технологий и увеличением знаний о микробиологии, методы анализа стали более точными, надежными. Сегодня используются методы ПЦР (полимеразная цепная реакция) и масс-спектрометрия, которые позволяют обнаруживать даже минимальные следы микроорганизмов.